El Consejo Nacional de Universidades es una institución nacional encargada de coordinar y asesorar a las universidades y centros de educación superior. Es un órgano colegiado compuesto por los rectores de las diez universidades miembros del consejo, al cual podrá asistir el ministro de educación, con derecho a voz más no a voto.

El CNU viene participando en los siguientes proyectos sobre educación superior: Proyecto PNUD: apoyo al proceso de reformas y modernización universitaria. Proyecto FAD: equipamiento tecnológico y capacitación.Proyecto BID: evaluación y acreditación, gestión y articulación de la Educación Superior.