La Unidad de Post Grado de Ciencias Sociales, aunque nació orgánicamente en 1985, al expedirse la Ley Universitaria N° 23733, recién empezó a funcionar en la práctica desde 1992, cuando la magíster Flor Lecca Bejarano, a la sazón su directora, consiguió dotarle de una infraestructura mínima. Le habían antecedido en el cargo, la doctora Rosa Fung Pineda (1985-1988), el doctor Manuel Burga Díaz (1988-1989) y la doctora Ruth Shady Solís (1989-1991). Las limitaciones económicas y la carencia de un local adecuado propiciaron el prolongado letargo de este periodo inicial.
A la magíster Flor Lecca, le sucedió en la dirección de la Unidad de Post Grado, el doctor Héctor Salazar Zapatero (1993-1995), Manuel Burga Díaz (1995-1999), César Germaná Cavero (2000-2004), y actualmente, el director es el doctor Julio Víctor Mejía Navarrete.
Primeras maestrías
La Unidad de Post Grado convocó a concurso de admisión en 1992, para la Maestría de Política Social, sin embargo, el número insuficiente de postulantes determinó que se postergase hasta el año siguiente. Ya en 1993, ingresaron los primeros 20 alumnos. El plantel de esta primera maestría estaba integrada por los doctores Jorge Gárate Salazar, Joel Jurado, Juan Herrera, Max Meneses, Santiago Alejandro Billón y Baltasar Caravedo, además de los magísteres Luis Pacheco, Manuel Castillo Ochoa, Teresa Tovar y Luis Ponce.
En 1994, se creó la Mención en Salud y Seguridad Social en la Maestría de Política Social, a solicitud de la Federación Médica Peruana y la Escuela de Enfermeros del Perú.
En estos tiempos también, en convenio con la Universidad Central de Venezuela, la Universidad Autónoma Gabriel René Moreno y la Universidad de La Habana, Cuba, se creó la Maestría en Ciencias Sociales y Filosofía Latinoamericanas, la que fue organizada conjuntamente con la Unidad de Post Grado de Letras y Ciencias Humanas. Asimismo, se creó la Maestría en Historia, con Mención en Historia Económica.
En el mismo periodo, se creó la Maestría en Ciencias de la
Religión con la participación de la doctora Dorothea Ortmann,
y los doctores Raimundo Prado, José Carlos Ballón, Héctor Salazar
y Tomás Gutiérrez.
Posteriormente, irían creándose las demás maestrías
y el doctorado en Ciencias Sociales que hoy ofrece esta institución
sanmarquina.
Últimas maestrías creadas
Una de las últimas maestrías creadas en esta unidad es la
Maestría Internacional en Desarrollo Sustentable que ofrece doble
titulación a nombre de la Universidad Nacional Mayor de San Marcos
y la Universidad Complutense de Madrid, adicionalmente, la Escuela Mayor
de Gestión Municipal de Lima, otorga el Diploma de Experto en Gestión
del Desarrollo Local. Igualmente se ha creado, la Maestría en Gestión
del Patrimonio Cultural.